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案例分享|中科82基因检测产品在遗传性肿瘤中的应用

日期:2022/11/9 9:02:37 发布人:

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临床信息

临床信息:受检者,女,34岁,腺癌ⅢA期。

检测项目:遗传性肿瘤82基因检测


02
检测结果

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检测结果:受检者携带APC基因:NM_000038.5:c.4393_4394delAG杂合变异,与Gardner综合征相关。


03
变异评级

变异评级致病 

PVS1:移码突变,变异使其编码的蛋白自第1465位氨基酸开始发生移码,导致提前出现终止密码子,预测发生无义介导的mRNA降解(NMD)。

PS4_Moderate:7名患者携带此变异[1-4]

PM2_Supporting:根据ESP数据库、千人数据库、gnomAD数据库分析,该变异位点的最高人群频率为0。


04
OMIM疾病介绍

家族性腺瘤性息肉病(Familial adenomatous polyposis,FAP)是一种易发展为结肠癌的综合征,平均发病年龄为16岁(发病范围:7-36岁),经典型FAP患者可表现为成百上千的结肠腺瘤性息肉,95%的经典型FAP患者在35岁时出现息肉,如不手术摘除癌化概率非常高(数据来源:GeneReviews)。Gardner综合征是FAP的一种变体,可伴有硬纤维瘤、骨瘤和其他类型的肿瘤[5]。FAP呈常染色体显性遗传,外显率接近100%,发病率约为1/6850-1/31250[6-7]


05
遗传咨询建议

家族性腺瘤性息肉病(Familial adenomatous polyposis,FAP)呈常染色体显性遗传,外显率接近100%。送检患者携带该致病变异,其生育患病后代的理论风险为50%。

如果家系中已有人确认携带了APC基因致病/疑似致病变异,建议对有患病风险的高危亲属进行该变异的筛查。


06
项目介绍

据目前的文献资料估计,遗传性肿瘤患者占恶性肿瘤患者总数的5%~10%,并且有升高的倾向。

本panel是一款对遗传性肿瘤相关基因进行检测的产品,涵盖人类基因组中与乳腺癌、卵巢癌、结直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、前列腺癌、多发性神经纤维瘤、结节性硬化症等多种肿瘤遗传相关的82个基因,通过对这些基因的胚系变异进行评估,既能为遗传性肿瘤患者查找致病基因,又能提示患者家属患肿瘤的风险,协助其积极主动采取针对性的健康方案,早检测早预防,有效降低肿瘤发生风险。

中科基因温馨提示:做好肿瘤遗传性检测能有效降低肿瘤发生风险。


参考文献:

1. Schäfer M, Kadmon M, Schmidt W, Treiber I, Moog U, Sutter C, Stehr M. Neonatal Gardner Fibroma Leads to Detection of Familial Adenomatous Polyposis: Two Case Reports. European J Pediatr Surg Rep;4(1):17-21,2016.

2. Dahl NA, Sheil A, Knapke S, Geller JI. Gardner Fibroma: Clinical and Histopathologic Implications of Germline APC Mutation Association. J Pediatr Hematol Oncol. 2016;38(5):e154-7.

3. Enomoto M, Konishi M, Iwama T, Utsunomiya J, Sugihara KI, Miyaki M. The relationship between frequencies of extracolonic manifestations and the position of APC germline mutation in patients with familial adenomatous polyposis. Jpn J Clin Oncol. ;30(2):82-8,2000.

4. Aceto G, Curia MC, Veschi S, De Lellis L, Mammarella S, Catalano T, Stuppia L, Palka G, Valanzano R, Tonelli F, Casale V, Stigliano V, Cetta F, Battista P, Mariani-Costantini R, Cama A. Mutations of APC and MYH in unrelated Italian patients with adenomatous polyposis coli. Hum Mutat. 200;26(4):394.

5. Nishisho, I., Nakamura, Y., Miyoshi, Y., Miki, Y., Ando, H., Horii, A., Koyama, K., Utsunomiya, J., Baba, S., Hedge, P., Markham, A., Krush, A. J., Petersen, G., Hamilton, S. R., Nilbert, M. C., Levy, D. B., Bryan, T. M., Preisinger, A. C., Smith, K. J., Su, L.-K., Kinzler, K. W., Vogelstein, B. Mutations of chromosome 5q21 genes in FAP and colorectal cancer patients. Science 253:665-669,1991.

6. Half E, Bercovich D, Rozen P. Familial adenomatous polyposis. Orphanet J Rare Dis. 2009;4:22.

7. Scheuner MT, McNeel TS, Freedman AN. Population prevalence of familial cancer and common hereditary cancer syndromes. The 2005 California Health Interview Survey. Genet Med. 2010;12:726–35.

8.何佳雪,姜艳芳. 高通量测序技术在临床诊治遗传性肿瘤中的应用与研究进展[J]. 中华预防医学杂志,2017,51(8):772-776.